可在交换战俘问题上，双方就分岐很大了。唐军希望将双方的战俘都释放，以示友好。
但周军俘虏的唐军人员中，有李孝恭、侯君集这样的重要人物。而唐军俘虏的周军人员，却几乎都是中低级军官和小兵，无足轻重。所以长孙无忌便坚持，一定要唐军支付大批赎金，才能换回李孝恭等人。
而李世民却并不想支付这笔钱，因为这完全不在自己的计划之内。而且他对于李孝恭的贪功冒进本来就有些生气，这些怨气自然而然就表现在了，对唐军谈判代表的授意上。
裴寂、段志玄两人在赎金上和长孙无忌、宋金刚争论了很久，导致谈判一度陷入僵局。
后来，李孝恭的一名老部下，偷偷派人回到长安，将此事通报了李孝恭的夫人。
李孝恭的夫人得知丈夫被擒，而李世民却在赎金上坚持不肯让步后，便到李渊宫中大哭大闹，弄得朝中宫中人人皆知。
李渊虽然对李孝恭也有些不满，但在这种情况下，他总不能因为少出几个钱就放弃李孝恭，这样将会让将士们寒心。更何况李孝恭还是自己的亲弟弟，更加不能放弃。于是，他只得派人到前线，通知李世民，马上答应宇文明的赎金要求。
李世民见是父皇的命令，虽然极不情愿，但也只好同意。于是谈判的最大难点得以解决。
大业十三年腊月三十日，以隋朝年号纪年的最后一天，唐周双方在夏县达成了《夏县休战协议》
协议内容主要有以下几点：
1、唐周双方从即日起，停止一切战争及敌对行为。
2、以双方的实际控制线为唐周双方的临时边界。未经对方允许，不得有军方人员进入对方领地。
3、双方不得为对方商人来本地经商、居住设置障碍。
4、一个月内，唐周双方均需全部释放对方的俘虏。
5、如果在协议期间，双方中有一方与第三方发生战争，则另一方不得向第三方提供军事援助和支持。
6、条约有效期为两年，从签定之日起生效。
在条约签订之前，唐朝就用五千两黄金赎回了李孝恭和侯君集两人，这样便避免了将支付赎金的丢脸之事，写入了条约之中。而双方其余的俘虏，则都没有什么异议，同意全部放回。
休战协议的最后一条，便是宣布此协议有效期为两年。因为双方都知道，两年之后，天下的形势又不知道发生了多少变化，很有可能双方将会面临一场大决战了。所以，就算时间再延长几年，到时也很有可能不会遵守。
条约签定之后，双方的军队便开始陆续撤军。宇文明命林子墨率三万军队驻守太原，并在所占河东中部和北部各郡县派驻了从数百到数千人不等的士兵担任郡兵。而现在他更是深深地感受到了自己人才的缺乏。
军队的将领倒还好说，可以以老带新，在基层军官中发现好苗子并加以提拔和培养。同时还开设了军校，让军官们进入学习，基本上可以杜绝庸才任命成高级军官。
可地方各地的官员就难办了。新打下来的山东、河东、河北之地。原有的官员大多被杀或者逃亡了，就算没有逃亡，宇文明也未必敢用他们。可治理地方，管理自己的地盘，又缺少大批能干又清廉的官员，这却让他犯了难。
虽然在回北平的路上，长孙无忌提议，可以从山东士族的子弟中，选取一些贤能者出任地方官员，但宇文明却不是太想这样做。
因为这样一来，便意味着再度向门阀世家低头，他会如同隋朝的开国皇帝杨坚一样，受到门阀贵族的制约。只不过，制约他的门阀从关陇贵族换成了山东士族而已。
“看来，还得慢慢培养一些，既忠于大周，又有治理地方能力的人才才行啊！”宇文明不禁自言自语道。
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