虽然晚了一点，洪秀全依旧抓捕了北王韦昌辉，并且重新整顿天京城的军队。在韦泽跑路之后，他让自己的两个族弟掌握了天京城的兵权，让张应宸带兵守住韦泽跑路之后变得空虚的常州镇江一线。
然而石达开毕竟是老谋深算，阴险狡诈。他并没有傻等在安庆，而是在西征军中豫王胡以晃病死，冬官正丞相罗大纲跑去投奔韦泽的机会，回到了太平天国的西征军中掌握了兵权。面对江西湘军咄咄逼人的态势，石达开宣布自己要打击湘军曾妖头，拱卫太平天国的安全。带着西征军进入江西，牢牢的控制了兵权。
面对石达开咄咄逼人的态度，洪秀全经过反复思考，最终杀了韦昌辉，把韦昌辉的首级送去石达开的军营中。然而，石达开继续提出了要求，在假惺惺的要求重点保护北王韦昌辉的亲族之后，又提出要杀了燕王秦日纲与佐天候陈承瑢。秦日纲与陈承瑢并非是北王韦昌辉的人，而是天王洪秀全的干将。洪秀全哪里肯就此屈服。幸好张应宸颇为能干，带领了五千部队抵挡住了直逼常州，并且开始重建江南大营的清军张国梁。
有了喘息之机的洪秀全把主意打到了韦泽头上，如果能够把韦泽请回天京城，翼王石达开在太平天国独大的局面就会被彻底改变。到了现在，洪秀全看得很清楚，韦泽与石达开根本不是一路人。双方从一开始就没有勾结，之后更没有合流的意思。韦泽实力强悍，在石达开之上，正好是用来平衡石达开的不二人选。洪秀全这才给韦泽写诏书，请求韦泽回到天国，并且加封韦泽为六千岁。
不过这样的美好设想被韦泽的檄文彻底打破，看到韦泽从根子上否定了太平天国的这套神权体系之后，洪秀全就明白了，韦泽不仅与石达开不是一路人，更是与他洪秀全不是一路人。
怒火中烧的愤恨了好一阵子，洪秀全终于暂时平静下来。能够斗倒杨秀清，洪秀全也绝非无能之辈。他或许不如杨秀清那般精通军事，他或许不如杨秀清那般精通行政，可洪秀全在政治上绝非外行。甚至可以称为高手。
先命人重写了请韦泽回来的诏书，洪秀全又发诏书到各地，宣布了他正式请韦泽回来的行动。韦泽的态度是一码事，洪秀全的态度是另外一码事。哪怕是明知道无法叫回韦泽，洪秀全也得证明他自己是竭尽全力了。
做完这件事，洪秀全向在安徽的北伐三丞相以及在扬州的曾立昌，告知他们洪秀全准备重建五军主将制度。而这四个人将是新的五军主将。林凤祥、李开芳乃是西王萧朝贵的旧部，而且林凤祥与李开芳是金田老兄弟，作为御前侍卫，曾经很忠于洪秀全。吉文元与曾立昌是林凤祥的部下，素来比较可靠。在石达开掌握了西征军之后，这四个人一直没有与石达开有过多的联系。
西征军中也并非是石达开一人天下，国宗杨辅清虽然与杨秀清没啥直接亲戚关系，却是被杨秀清认为同宗，得到了国宗的地位，这是尚存的东王一系。韦昌辉的弟弟韦俊自然是北王一系。虽然这两派都与天王洪秀全有着深刻矛盾。不过石达开本人只是阴险而已，他在杀杨秀清的时候也是同谋。在杀韦昌辉的事情上，石达开更是主要推手。
先控制了北伐三丞相与非常善战的曾立昌，洪秀全还是有能力与石达开继续对抗的。但是，洪秀全却也做了另外的准备，处理外天京城外的事务之后，他命人请秦日纲与陈承瑢见驾。
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