为了挽回自己在天皇面前的形象，同时为了扔掉莫名其妙背上的黑锅，东条在当天下午就坐上了一架百式运输机直飞台北，在台北稍作停顿之后，飞机再连夜起飞，转经海南岛做短暂的停留之后，在当天的午夜时分降落在了南宁城外机场。与陆军大臣同机到达的还有参谋次长泽田茂以及作战科长冈田重一大佐、参谋本部第二部长土桥勇逸少将、新上任的陆军宪兵司令官丰岛房太郎中将和宪兵警务科科长四方谅二中佐。
第五师团的师团长中村明人自知这次罪责难逃，所以当获知陆军大臣亲自出马前来调查的消息，连忙跑到机场迎接，他还想试图在此时讨好一下东条，为自己免掉一些责任，毕竟一个实权师团长的刻意投靠对于陆军大臣来讲也是不小的助力。不过中村显然是打错了算盘，他的未来在东京的御前会议上就已经决定了，没人能够拯救这位可怜的中将，他此刻应该感到庆幸自己并不孤单，还有一大批同僚将会陪着他一起完蛋，在此次事件中他算不上是最大的那只替罪羊，在他上面还有好几个倒霉蛋。
当看到随机而来的还有宪兵部队的将领，中村就知道这一次在劫难逃了，果然还未等到他向东条发起申辩，对方就已经拿出了一份天皇御批的命令书，解除了中村明人第五师团师团长的职务，并且由宪兵司令当场予以逮捕，交由宪兵队进行调查审讯。与中村中将同时被逮捕的还有第五师团的参谋长和师团部参谋，以及森本大队的上级长官第二十一联队联队长三木吉之助。
当天晚上这些人就被押送进了临时设置的宪兵监狱，由日本宪兵警务科科长亲自进行了初步的询问。对于东条来说，这还只是一个开始，他要利用这次机会，好好煞一下陆军中那种无视上官散漫无礼的习性，同时在陆军中好好树立一下剃刀东条的威名，让那些喜欢头脑发热的马鹿一听到他的名字就从骨子里感到畏惧，干蠢事之前会仔细考虑一下后果，不要给帝国与天皇陛下增添麻烦。
对于日本来说，现在的麻烦已经够多了，光是一个中国战场就已经让人焦头烂额，如果再引起欧洲强国介入，对于目前的日本来讲将是一场灾难。陆海军虽然已经确定了南进的战略，但是积聚起足够的资源与力量需要大量的时间，仏国之前的增兵已经打乱了参谋本部之前的推演，海军方面差一点就为了登陆的问题要跟陆军翻脸。这种时候要是再出现什么变数，南进计划说不定就会因此流产。到时候谁能承担这个责任，反正东条知道自己的小身板是绝对扛不起来的。
第二天南支派遣军宪兵队的林清中佐带着他的精兵强将赶到了南宁，随即宪兵们在陆军大臣的直接指示下，在第五师团里掀起了一场腥风血雨，第二十一联队首当其冲成为了一个重灾区，所有和森本有关的人员都被宪兵带走调查。森本大队留守的人员被宪兵们视为了最佳的突破口，特别是那两名最终逃回中国境内的幸存者更是受到了严酷的审讯。
一开始还有部分赞同森本行为的少壮军官，自视在国内有后台有背景，对宪兵的询问表现出了明显的抵触情绪，随即宪兵队的刑讯专家们就用事实向他们证明自己的骨头并没有想象中那么坚硬，日本宪兵的残暴可是天下闻名的，既然有陆军大臣撑腰，更是没有了什么顾虑，当那些宪兵士官军曹面对着这些以往需要仰视的中高级军官时，宪兵士官们从对方的哀嚎声中获得了充分的快感，三木之下还有什么供词是拿不出来的，很快一份份详细的审讯报告就放到了东条的面前。
东条干净利索的完成了内阁交付给他的任务，成功的在三天之内交出了一份事件调查报告，虽然和仏国独国方面的说法有些细节上出入，但是东条相信自己调查出来的应该就是事实。
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